Si mund të ketë lindur Varianti Omicron i COVID-19?

Një nga tiparet e pazakonta dhe më intriguese të mutacioneve të mëdha mikron varianti është se ai fitoi të gjitha mutacionet në një shpërthim të vetëm në një hark kohor shumë të shkurtër. Shkalla e ndryshimit është aq e madhe sa që disa njerëz mendojnë se mund të jetë një lloj i ri njerëzor koronavirus (SARS-CoV-3 ?). Si mund të ketë ndodhur një nivel kaq i lartë mutacioni në një periudhë kaq të shkurtër? Disa argumentojnë se mikron mund të ketë evoluar nga një pacient i imunizuar i shtypur me ndonjë infeksion kronik si HIV/AIDS. Ose, a mund të ketë evoluar në valën aktuale në Evropë e cila ka dëshmuar ritme shumë të larta transmetimi? Ose, a mund të lidhet me ndonjë hulumtim të funksionit të fitimit (GoF) apo ndonjë gjë tjetër? Kush përfiton? Nuk është e mundur të nxirret ndonjë përfundim në këtë fazë. Megjithatë, ky artikull përpiqet të hedhë dritë mbi dimensione të ndryshme që lidhen me fenomenin.  

Varianti i ri COVID-19 i raportuar së fundmi nga Afrika e Jugut më 25^th Nëntori 2021 është përhapur në disa vende të botës, përkatësisht në MB, Kanada, Japoni, Australi, Austri, Hongkong, Izrael, Spanjë, Belgjikë, Danimarkë dhe Portugali. Ky është përcaktuar si një variant i ri shqetësimi (VOC) nga OBSH dhe është emëruar mikron. Omicron karakterizohet nga 30 ndryshime të aminoacideve, tre fshirje të vogla dhe një futje e vogël në proteinën spike në krahasim me virusin origjinal.¹. Megjithatë, bazuar në shkallët e mutacioneve² nga viruset ARN, nuk është e mundur të zhvillohen 30 plus mutacione brenda natës. Do të duheshin të paktën 3 deri në 5 muaj për të gjeneruar 6 mutacione në gjenomën 30 kb të SARS-CoV-2 bazuar në shkallën e mutacionit që virusi pëson natyrshëm² pas transmetimit nga pritësi në host. Duke ecur sipas kësaj llogaritjeje, duhet të ishin dashur 15-25 muaj që të dilte diçka si Omicron, me 30 mutacione. Megjithatë, bota nuk e ka parë këtë mutacion gradual të rritet gjatë periudhës së përmendur kohore. Argumentohet se ky variant evoluoi nga një infeksion kronik i një pacienti me imunitet të kompromentuar, ndoshta një pacient me HIV/AIDS të patrajtuar. Bazuar në shkallën e ndryshimit, ai duhet të klasifikohet fare mirë si një lloj i ri virusi (SARS-CoV-3 mund të jetë). Megjithatë, numri i mutacioneve të pranishme mund të jetë tregues i transmetueshmërisë së tij më të lartë se variantet e tjera. Megjithatë, kërkohen më shumë studime për ta konfirmuar këtë. 

Javët e ardhshme janë kritike për të përcaktuar transmetueshmërinë e variantit të ri dhe ashpërsinë e sëmundjes që shkakton. Deri më tani, të gjitha rastet kanë qenë të lehta dhe asimptomatike dhe lajmi i mirë është se nuk ka pasur vdekshmëri. Ne gjithashtu duhet të vlerësojmë shkallën në të cilën varianti i ri mund t'i shpëtojë mbrojtjes imune të ofruar nga vaksinat aktuale. Kjo do të na lejojë të vendosim për sa kohë mund të vazhdojmë me vaksinat aktuale përpara se t'i bëjmë ato për variantin e ri. Pfizer dhe Moderna tashmë kanë ndërmarrë hapa drejt ndryshimit të vaksinave të tyre. Megjithatë, ende mbetet pyetja rreth origjinës së këtij varianti. Është e besueshme që varianti Omicron mund të ketë evoluar në valën aktuale të incidencës më të lartë të rasteve në Evropë shumë më herët, por është raportuar nga autoritetet e Afrikës së Jugut kohët e fundit (bazuar në sekuencën e gjenomit). Megjithatë, kjo mund të mos jetë kështu pasi vala aktuale ka qenë aty për 4-5 muajt e fundit dhe sipas shkallës së mutacioneve, duhet të kishte rezultuar në jo më shumë se 5-6 mutacione. 

Ose ishte mikron, një produkt i kërkimit të fitimit të funksionit (GoF) që çon në zhvillimin e patogjenëve potencialë pandemikë (PPP)^3,4. Hulumtimi i fitimit të funksionit i referohet eksperimenteve në të cilat një patogjen (në këtë rast SARS-CoV-2), fiton aftësinë për të kryer një funksion që përndryshe nuk ishte pjesë e ekzistencës së tij të rregullt. Në këtë rast, mund të çojë në rritje të transmetueshmërisë dhe rritje të virulencës. Kjo potencialisht mund të çojë në zhvillimin e një organizmi që është i ri dhe që nuk kishte ekzistuar në natyrë. Synimi i hulumtimit të GoF është të kuptojë variantet patogjene dhe të jetë gati me një terapeutik ose një vaksinë, nëse një variant i tillë lind në natyrë. Numri i mutacioneve të fituara nga PPP-të, jo vetëm që e bëjnë shtamin shumë të transmetueshëm, por gjithashtu ndihmon për t'i shpëtuar antitrupave neutralizues të krijuar kundër virusit origjinal te individët konvaleshent. Përveç kësaj, manipulimi i tendosjes është i mundur duke përdorur teknika moderne të inxhinierisë gjenetike të bazuara në rikombinimin e synuar të ARN-së⁵. Kjo gjithashtu mund të çojë në variante/shtame të reja patogjene me numër më të madh mutacionesh, duke çuar në një virus shumë të transmetueshëm dhe virulent. Hulumtimet kanë treguar se 20 mutacione që ndodhin në proteinën e majës, duke përfshirë ndryshimet dhe fshirjet, janë të mjaftueshme për shmangien e shumicës së antitrupave të gjeneruar në plazmën e individëve që janë infektuar ose vaksinuar kundër SARS-CoV-2.⁶. Sipas një studimi tjetër, nën një presion të fortë imunitar, SARS-CoV-2 mund të fitojë aftësinë për të shpëtuar nga antitrupat duke bërë vetëm 3 ndryshime, dy fshirje në domenin terminal N dhe një mutacion (E483K) në proteinën e majës.⁷. 

A duhet lejuar ky lloj hulumtimi që çon në gjenerimin e PPP-ve? Në fakt, kërkimi i përfitimit të funksionit u ndalua nga SHBA në vitin 2014 nga NIH, pas një sërë aksidentesh që përfshinin patogjenë të keqpërdorur në Qendrat e SHBA për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve, duke sugjeruar se rreziqet që lidhen me një lloj kërkimi të tillë, janë shumë më të mëdha se përfitimet që mund të ofrojë. Kush përfiton nga shfaqja dhe përhapja e PPP-ve të tilla? Këto janë pyetje të vështira që kërkojnë përgjigje reale.  

*** 

Referencat:  

1. Qendra Evropiane për Parandalimin dhe Kontrollin e Sëmundjeve. Implikimet e shfaqjes dhe përhapjes së SARSCoV-2 B.1.1. 529 varianti i shqetësimit (Omicron), për BE/ZEE. 26 nëntor 2021. ECDC: Stokholm; 2021. E disponueshme në internet në https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529   

2. Simmonds P., 2020. Hipermutacioni i shfrenuar C→U në gjenomet e SARS-CoV-2 dhe Coronaviruseve të tjerë: Shkaqet dhe Pasojat për Trajektoret e tyre Evolucionare Afatshkurta dhe Afatgjata. 24 qershor 2020. DOI: https://doi.org/10.1128/mSphere.00408-20 

3. NIH. Hulumtimi që përfshin patogjenë të mundshëm të përforcuar pandemik. (faqja e rishikuar më 20 tetor 2021. https://www.nih.gov/news-events/research-involving-potential-pandemic-pathogens  

4. Zhvendosja e rërës së kërkimit të 'fitimit të funksionit'. Nature 598, 554-557 (2021). doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-02903-x 

5. Bert Jan Haijema, Haukeliene Volders dhe Peter JM Rottier. Ndërrimi i tropizmit të specieve: Një mënyrë efektive për të manipuluar gjenomin e koronavirusit të maces. Journal of Virology. Vëll. 77, Nr. 8. DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.77.8.4528-4538.20033 

6. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Barrierë e lartë gjenetike për arratisjen e antitrupave neutralizues poliklonal SARS-CoV-2. Natyra (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

7. Andreano E., et al 2021. Arratisja SARS-CoV-2 nga një plazma konvaleshente shumë neutralizuese e COVID-19. PNAS 7 shtator 2021 118 (36) e2103154118; https://doi.org/10.1073/pnas.2103154118 

***